Carlos Bocanegra fue nombrado Director Deportivo de Atlanta United el 2 de marzo de 2015. En medio de una de las temporadas de expansión más impresionantes en la historia de la MLS, ya que el club se convirtió en el primer equipo de expansión en clasificar para los Playoffs de la MLS desde 2009, Bocanegra fue ascendido a Vicepresidente y Director Deportivo el 10 de octubre de 2017. Firmó una extensión de contrato por varios años el 15 de noviembre de 2021. Bocanegra estableció el currículo a largo plazo del club y supervisa todas las operaciones de fútbol, incluyendo el personal y las transacciones de jugadores, la gestión del personal y la búsqueda de talentos para el Primer Equipo, ATL UTD 2 y el programa de la Academia. En 2020, Bocanegra fue incluido en el Salón de la Fama Nacional del Fútbol.

Bajo el liderazgo de Bocanegra, Atlanta ganó la MLS Cup en 2018, la U.S. Open Cup en 2019 y se convirtió en el primer equipo de la MLS en ganar la Campeones Cup en 2019. Además de sus dos trofeos durante la temporada 2019, Atlanta estableció un récord de la MLS de la mayor cantidad de puntos obtenidos por un campeón defensor (58). Después de no clasificar para los Playoffs durante una temporada 2020 acortada por la pandemia de Covid-19, Atlanta volvió a clasificar para los Playoffs de la MLS en 2021, marcando la cuarta vez en la historia del club. Es uno de los cuatro equipos de la Conferencia Este que se ha clasificado para cuatro de los últimos cinco Playoffs de la MLS, junto con NYCFC, New York Red Bulls y Philadelphia Union. El club ha acumulado la tercera mayor cantidad de puntos en la MLS desde que se unió a la liga en 2017, convirtiéndose en el cuarto equipo de la MLS en clasificar para la Liga de Campeones de la Concacaf durante tres años consecutivos (2019-2021).

Bocanegra encabeza la construcción de la plantilla de Atlanta, la cual, antes de la temporada de expansión del club, estableció un modelo de adquisición de Jugadores Franquicia más jóvenes en su mejor momento. El club fichó a su primer Jugador Franquicia, Tito Villalba, en julio de 2016, seis meses antes de su primera pretemporada y antes de anunciar a un entrenador principal. Unos meses después, Atlanta sumó dos fichajes destacados en Miguel Almirón y Josef Martínez. Almirón fue la Mejor Contratación de la MLS en 2017 y fue seleccionado para el Once Ideal de la liga en cada una de sus dos temporadas en Atlanta. El paraguayo fue vendido al Newcastle United de la Premier League por una tarifa de transferencia récord de la MLS en 2019. Martínez ha sido seleccionado para el Once Ideal de la MLS en tres ocasiones, ha sido convocado al Partido de las Estrellas en dos ocasiones y fue el MVP de la MLS, el MVP de la MLS Cup y el máximo goleador después de romper el récord de goles en una sola temporada de la liga con 31 goles. En 2021, Martínez se convirtió en el jugador más rápido en la historia de la MLS en alcanzar los 100 goles en todas las competiciones. En general, Atlanta ha tenido más jugadores franquicia para el Juego de las Estrellas de la MLS (15) desde 2017 que cualquier otro club, con LAFC en segundo lugar con nueve.

En la histórica temporada de expansión del club en 2017, Bocanegra formó un equipo que empató en el quinto lugar de todos los tiempos en goles anotados en una sola temporada (70) y en el cuarto lugar de diferencia de goles (+30). Esto fue liderado por la contratación de un trío de Jugadores Designados en Martínez, Almirón y Villalba, quienes combinaron para marcar 41 goles, una cifra superior a la de otros cinco equipos de la MLS. Bocanegra también tuvo éxito a través de otros mecanismos de adquisición de jugadores, al elegir al defensor actual del equipo nacional de los Estados Unidos, Miles Robinson, y al Novato del Año de la MLS en 2017, Julian Gressel, con las selecciones generales número 2 y número 8 en el SuperDraft de la MLS de 2017. El exdefensor del equipo nacional de los Estados Unidos también construyó una sólida defensa en la temporada de expansión del club, ya que el equipo permitió la cuarta menor cantidad de goles en la MLS (40). Bocanegra comenzó a construir la línea defensiva en diciembre de 2016, al intercambiar al defensa central Michael Parkhurst del Columbus Crew SC y fichar al lateral izquierdo Greg Garza a préstamo del Tijuana. Ambos jugadores fueron seleccionados para el Juego de las Estrellas de la MLS en 2017.

Después de una histórica temporada de expansión, Bocanegra continuó ayudando a impulsar al club hacia una extraordinaria temporada en 2018, que culminó con la conquista de la MLS Cup. El club también se clasificó para la Liga de Campeones de la Concacaf después de terminar con el mejor récord combinado de dos años en toda la MLS. Bocanegra formó uno de los ataques más prolíficos en la historia de la liga, ya que Atlanta se convirtió en el segundo equipo en la historia de la MLS en producir temporadas consecutivas de 70 goles, liderado por el MVP de la MLS en 2018, Josef Martínez, quien rompió el récord de goles en una temporada de la liga. El equipo también tuvo la segunda mejor diferencia de goles (+56) en un lapso de dos años en la historia de la liga, al tiempo que estableció un nuevo récord de victorias en condición de visitante (10) en la era posterior a la tanda de penales. El club finalizó 2018 con el segundo mayor total de puntos (69) en la historia de la liga.

Bocanegra también supervisa la Academia del club, que se estableció en 2016, un año antes de que el equipo de la MLS disputara su primer partido. La Academia ha producido 12 jugadores formados en casa y más de 40 jugadores han firmado con programas de la NCAA de División I. El destacado defensor George Bello se convirtió en el primer jugador formado en casa de Atlanta United en recibir una convocatoria al primer equipo nacional de los Estados Unidos y ha disputado seis partidos, todos ellos en 2021, incluida la Final de la Copa Oro 2021 contra México.

Bocanegra fue el único miembro de la clase del Salón de la Fama Nacional del Fútbol de 2020 y todavía está muy involucrado en el programa de fútbol de los Estados Unidos, donde actualmente se desempeña como copresidente del comité de desarrollo técnico que se estableció en abril de 2018. También fue miembro de la junta directiva de la candidatura conjunta de Estados Unidos, Canadá y México para la Copa Mundial de la FIFA 2026, que finalmente fue seleccionada por la FIFA para ser la sede del torneo.

Como excapitán de la selección nacional de los Estados Unidos durante seis años, Bocanegra se retiró de la competencia en 2014 después de una carrera de 15 años que incluyó más de 200 apariciones en Inglaterra, Francia y Escocia. Nacido en California, Bocanegra asistió a la poderosa universidad de fútbol de UCLA y fue seleccionado por el Chicago Fire en el SuperDraft de la MLS de 2000. En Chicago, ganó el premio al Novato del Año de la MLS en 2000 y el premio al Mejor Defensor de la MLS en 2002 y 2003. Al año siguiente, fichó por el club de la Premier League inglesa Fulham, donde jugó cuatro temporadas y se convirtió en uno de los pocos jugadores estadounidenses en ser capitán tanto de su club como de su país al mismo tiempo. Después de su paso por el Fulham, Bocanegra se mudó a la Ligue 1 de Francia, donde jugó para Rennes y Saint-Étienne hasta unirse al Rangers de la Scottish Premier League hasta 2013. En julio de 2013, regresó oficialmente a la MLS para jugar en Chivas USA, donde finalizó su carrera con el récord de más goles internacionales anotados por un defensor estadounidense.

A nivel internacional, Bocanegra fue convocado al equipo nacional de los Estados Unidos para las Copas Mundiales de la FIFA 2006 y 2010, donde disputó un total de seis partidos. Ocupa el puesto 11 en la historia del fútbol de los Estados Unidos con 110 apariciones. También ayudó a liderar al equipo nacional de los Estados Unidos a dos victorias en la Copa Oro en 2002 y 2007, y anotó un impresionante total de 14 goles durante su carrera internacional. Fue capitán del equipo nacional de los Estados Unidos en 64 ocasiones durante su carrera internacional.

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